茗屿中心小学前身是西河国民学校，于1913年由双庙村清举人高谊（性朴）发起创立，为当时北白象和磐石之间唯一的一所小学。1937年改名为白象镇十三保国民学校。1949年，改称双庙小学，翌年又称石北乡小学，1953年，称石北乡辅导小学，1961年9月，改称茗屿公社中心小学，至1984年，使用今名。

2003年9月，中心校由双庙村喜迁瑞里村新校区（象石公路东首），同时兼并了下属完小瑞里小学。现在，学校有琯头小学、高岙小学、白鹭屿小学三所完小，全片学生2450多人，教师120余名。

2005年，学校获得了浙江省九年义务教育标准化学校、乐清市二星级学校、乐清市小学生日常行为规范达标学校、乐清市先进职工之家等一系列荣誉称号。